Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZFHX3Q15911 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZFHX3Q15911 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZFHX3Q15911 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZFHX3Q15911 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZFHX3Q15911 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZFHX3Q15911 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZFHX3Q15911 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms