Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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SCN9AQ15858 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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SCN9AQ15858 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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