Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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