Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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UBE3CQ15386 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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UBE3CQ15386 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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