Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTF1Q15361 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF1Q15361 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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