Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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IRF4Q15306 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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IRF4Q15306 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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IRF4Q15306 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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IRF4Q15306 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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IRF4Q15306 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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IRF4Q15306 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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IRF4Q15306 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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IRF4Q15306 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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IRF4Q15306 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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IRF4Q15306 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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