Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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