Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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