Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCF4Q15080 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCF4Q15080 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCF4Q15080 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCF4Q15080 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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