Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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BRD3Q15059 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRD3Q15059 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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