Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
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