Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCLAFQ15004 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms