Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSME4Q14997 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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