Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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