Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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GPNMBQ14956 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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GPNMBQ14956 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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