Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms