Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM25Q14258 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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