Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX2Q13950 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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