Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms