Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOFQ13790 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOFQ13790 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOFQ13790 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOFQ13790 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOFQ13790 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOFQ13790 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOFQ13790 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOFQ13790 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOFQ13790 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOFQ13790 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms