Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4AQ13619 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
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