Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPRSQ13332 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPRSQ13332 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPRSQ13332 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRSQ13332 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRSQ13332 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRSQ13332 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRSQ13332 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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