Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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