Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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RESTQ13127 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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RESTQ13127 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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RESTQ13127 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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RESTQ13127 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RESTQ13127 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RESTQ13127 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RESTQ13127 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RESTQ13127 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RESTQ13127 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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RESTQ13127 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RESTQ13127 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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