Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP4Q13115 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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