Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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