Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms