Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFEMP1Q12805 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFEMP1Q12805 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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