Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD3Q0VAK6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms