Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms