Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms