Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FMODQ06828 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1148.1 ms