Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREMQ03060 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms