Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TOP2BQ02880 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms