Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AP000842.1-201ENST00000524467 698 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms