Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OC90Q02509 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OC90Q02509 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OC90Q02509 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OC90Q02509 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OC90Q02509 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OC90Q02509 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OC90Q02509 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OC90Q02509 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms