Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms