Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms