Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms