Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms