Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTBN1Q01082 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms