Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF9Q00978 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms