Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms