Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms