Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TFAMQ00059 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TFAMQ00059 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms