Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMF1P82094 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMF1P82094 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMF1P82094 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMF1P82094 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMF1P82094 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMF1P82094 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMF1P82094 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMF1P82094 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMF1P82094 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMF1P82094 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms