Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IP78347 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms