Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms