Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEFA3P59666 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms