Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSWP56202 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSWP56202 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSWP56202 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSWP56202 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSWP56202 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSWP56202 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms